O Sistema de Gestão Ambiental (SGA) da Marina de Vilamoura foi certificado pela SGS-ICS em 2002. Em 2003, o âmbito da certificação foi estendido à Praia da Rocha Baixinha e um ano mais tarde, foi incorporada a vertente da qualidade no sistema de gestão existente, de acordo com a Norma ISO 9001, tendo sido atribuída a certificação do sistema integrado ainda em 2004. Em 2009, o âmbito da certificação foi estendido à Praia de Vilamoura.